施行大便移植的医生对这个管理瓶颈甚为不满 ， 因为目前急需治疗艰难梭菌感染的新方法 。 过去30年中 ， 作为公认的因抗生素治疗而引起的后果 ， 艰难梭菌感染已从还可忍受 ， 演变成了一种严重的健康威胁 。 自2000年一个新的剧毒菌株出现起 ， 感染病例变得日益常见 ， 除了老人 ， 儿童、孕妇和并无明显健康风险的人也会中招 。 一项研究估计 ， 从2000年到2005年 ， 因艰难梭菌感染入院就诊的成年患者数量增加了一倍多 ， 由134 000例增加到291 000例 。 另有一项研究表明 ， 艰难梭菌感染在普通人群中的致死率增加了3倍 ， 由1999年的每百万人5.7例增加到2004年的每百万人23.7例 。
艰难梭菌感染也越来越难治了 。 拜抗生素耐药性增强所赐 ， 标准疗法目前需要依赖两种药物：甲硝唑和万古霉素 。 两种药都是所谓的广谱抗生素 ， 这意味着它们能对付的细菌种类很广 。 因此 ， 当使用这两种药物治疗艰难梭菌感染时 ， 它们也会杀死肠道内大部分的有益细菌 。 这些细菌曾经占据的空间 ， 随后就会成为在药物攻击中存活下来的艰难梭菌的乐土 。 结果 ， 曾经发生过一次艰难梭菌感染的患者约有20%会复发；复发过一次的患者约有40%会再次复发；复发两次的患者约有60%还会再复发几次 。 有些患者别无选择 ， 只能切除结肠 。 [2011年5月 ， FDA通过了一种对抗艰难梭菌感染的新药——非达霉素（fidaxomicin） ， 这是一种窄谱抗生素 ， 用药后的复发次数会减少 。 ]
【绕开大便移植的藩篱】
为什么移植微生物能够消除艰难梭菌感染 ， 具体机制还没完全研究清楚 ， 不过美国明尼苏达大学的胃肠病学家、免疫学家亚历克斯·克鲁茨（Alex Khoruts）已经证实 ， 植入的细菌确实会接管肠道 ， 替代“缺席”的有益细菌 ， 打败艰难梭菌 。 过去两年多 ， 他已经做了20多次大便移植 。 曾有一位61岁的女性患者饱经艰难梭菌的折磨 ， 因为感染反复发作 ， 她只能穿上尿布 ， 片刻不离轮椅 。 2010年 ， 克鲁茨分析了这位患者的肠道菌群的遗传特征 ， 结果发现 ， 在接受丈夫的大便移植物之前 ， 她体内完全没有能够代表健康肠道环境的细菌；而接受移植并且痊愈后 ， 她肠道的细菌组成不仅恢复了正常 ， 还和他丈夫的一模一样 。
施行大便移植的大部分临床医生都让患者自己寻找便样提供者 ， 患者的孩子、兄弟姐妹、父母或配偶是首选 。 “我觉得 ， 这是很有美感的事 ， ”美国华盛顿大学的医学教授克里斯蒂娜·苏拉维茨（Christina Surawicz）说 ， 她为24位患者做了移植 ， 发表了一篇关于前19例移植的报道 。 “把别人的大便放进自己的结肠 ， 这是一件很亲密的事 ， 谁和你最亲密？当然是配偶” 。
为确保安全 ， 实施这种疗法的医生会要求便样提供者不能患有消化系统疾病 ， 健康水准要达到可献血的水平 。 这个程序会耗费不少时间和后勤资源 ， 因为医疗保密准则要求 ， 供者和潜在受者得分开接受调查 。 而且 ， 其中还涉及一个无法避免的经济问题：供者的实验室检查项目一般不在医保范围内 ， 患者的保险有可能报销移植费用 ， 也可能不报销 。
大便移植的支持者已经想出办法来绕开这些可能存在的藩篱 。 克鲁茨不再使用和患者存在亲属关系的供者（这意味着要为每个病例都寻找供者） ， 转而从本地的卫生工作人员中招募了一支“万能供者”队伍（他发现 ， 大便移植的次数并没有因此变化） 。 2010年 ， 加拿大多伦多大学的迈克尔·西尔弗曼（Michael Silverman）大胆采用了一个尚未成熟的方案：使用在药店就能买到的灌肠工具 ， 让患者在家接受移植 。 他在《临床胃肠病学和肝脏病学》（Clinical Gastroenterology and Hepatology）杂志中提醒大家 ， 这么做的缺点是 ， 大便溶液太多 ， 移植后也许会漏出 。 不管怎么说 ， 已有7位艰难梭菌感染复发的患者安全接受了家庭移植 ， 康复率达100% 。
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