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现今已知鸟类分为多个亚纲，即古鸟亚纲、今鸟亚纲、反鸟亚纲、蜥鸟亚纲 。下面介绍最著名的两个亚纲：古鸟亚纲以始祖鸟（Archaeopteryxlithographica）为代表，它也可能是恐爪龙类，那样该亚纲会被废除 。今鸟亚纲包括白垩纪以来的一些化石鸟类以及现存鸟类 。化石鸟类以黄昏鸟目和鱼鸟目为代表，它们的骨骼近似现代鸟类但上、下颌具槽生齿 。现存今鸟亚纲鸟类可归为3个总目，即：一、平胸总目为现存体型最大的鸟类（体重大者达135kg，体高2．5m），适于奔走生活 。具有一系列原始特征：翼退化、胸骨不具龙骨突起，不具尾综骨及尾脂腺，羽毛均匀分布（无羽区及裸区之分）、羽枝不具羽小钩（因而不形成羽片），雄鸟具发达的交配器官，足趾适应奔走生活而趋于减少（2～3趾） 。分布限在南半球（非洲、美洲和澳洲南部） 。平胸总目的著名代表为鸵鸟（Struthiocamelus）或称非洲鸵鸟，其他代表尚有美洲鸵鸟（Rheaamericana）及鸸鹋（或称澳洲鸵鸟）（Dromausnova-chollandeae） 。此外在新西兰尚有几维鸟（Apteryxoweni） 。二、企鹅总目潜水生活的中、大型鸟类，具有一系列适应潜水生活的特征 。前肢鳍状，适于划水 。具鳞片状羽毛（羽轴短而宽，羽片狭窄），均匀分布于体表 。尾短 。腿短而移至躯体后方，趾间具蹼，适应游泳生活 。在陆上行走时躯体近于直立，左右摇摆 。皮下脂肪发达，有利于在寒冷地区及水中保持体温 。骨骼沉重而不充气 。胸骨具有发达的龙骨突起，这与前肢划水有关 。游泳快速，有人称为“水下飞行” 。分布限在南半球 。企鹅总目的代表为王企鹅（Aptenodytespatagonicus） 。三、突胸总目突胸总目包括现存鸟类的绝大多数，分布遍及全球，总计约35个目，8500种以上 。它们共同的特征是：翼发达，善于飞翔，胸骨具龙骨突起 。最后4～6枚尾椎骨愈合成一块尾综骨 。具充气性骨骼 。正羽发达，构成羽片，体表有羽区、裸区之分 。雄鸟绝大多数均不具交配器官 。
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