茶树EST-SSR的信息分析与标记建立

在1589条茶树EST中 , 共发掘出了281个EST-SSR , 分布于246条EST中 , 出现频率是17.68% , 平均长度为33.06bp , 平均分布频率是1 , 2.61kb 。 在茶树EST-SSR中 , 二核苷酸重复是主要的重复类型 , 出现最多的重复基元类型是AG/CT重复 。 设计了19对SSR引物 , 在对引物、dNTP、MgCl2的浓度及退火温度等参数进行测试后 , 建立了合适的PCR反应体系 。 以衍生绝大多数EST-SSR的龙井43DNA为模板 , 对引物进行了筛选 , 有16对引物显示扩增 , 可用率为84.2%;进一步在10个茶树品种中进行多态性测试 , 显现出多态性的引物占可扩增引物的62.5% 。 本文研究结果证明了根据茶树EST建立SSR标记是有效、可行的 。 【茶树EST-SSR的信息分析与标记建立】完成机构:[1]浙江大学原子核农业科学研究所,浙江杭州310029 [2]杭州市农业科学院,浙江杭州310024

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