5、向工商行政机关申请调查取证
商业秘密权利人发现商业秘密被侵犯时，可以根据《关于禁止侵犯商业秘密行为的若干规定》的规定向各级工商行政管理机关申请查处 。工商管理机关在查处过程中有权对侵权产品进行查封、可以根据需要查阅、复制与案件有关的合同、账册等有关文件;询问当事人和证人;采用测量、拍照、摄像等方式进行现场勘验 。工商管理机关依法通过以上行为获取的文件、笔录和实物都是证明侵权人侵权的有力证据，在法庭上具有很高的证据效力 。商业秘密权利人可以根据发现侵权行为时的具体情况，决定是否采取该种途径收集证据 。
6、通过公安机关调查取证
公安机关是我国法定的侦查案件的机关，拥有强大的侦查力量体、先进的技术设备，丰富的侦查经验，国家赋予其侦查权力 。侵犯商业秘密罪刑事案件一般具有犯罪手段隐蔽、被害人举证困难的特点，选择公安机关介入是比较明智的选择 。我国《刑事诉讼法》规定，商业秘密权利人发现侵害事实时，可以向公安机关报案，公安机关认为满足立案侦查条件的予以立案，并且采用专门的侦查手段调查取证 。
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