如何利用已知pfam号与HMM寻找基因家族
需要这些哦
hmm
电脑
方式/
1起首 ， 操纵已有的基因号 ， 植物的话上https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html ， 找到基因的卵白质序列
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2【利用Hmm建模找基因家族】随后 ， 将序列复制 ， 而且进入http://smart.embl-heidelberg.de/
将氨基酸序列粘贴进去 ， 可看见
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3点击红色指示区域 ，
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4再进入http://pfam.xfam.org/ ， 接下来按照操作一步步走
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5下载完毕 ， 将所要找的基因组库与这个hmm模子均放在hmm的文件夹下面 ， 如图
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6打开下载好的HMM文件 ， 必然要将红色箭头标注处改为b ， 不然windows运行不了
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7再打开号令提醒符 ， 即cd
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8然后就完当作啦啦啦啦
看图
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注重事项hmm下载后的文件 ， 必然要必然要将红色箭头标注处改为b！！！
以上内容就是利用Hmm建模找基因家族的内容啦 ， 希望对你有所帮助哦！
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