首先，甲鱼的冬眠是根据温度决定的 。通常在温度低于二十摄氏度时，甲鱼就很少进食了，在此之前，甲鱼会疯狂的进食来储存能量 。当温度降低到12℃时，它们就会潜入泥沙中进行冬眠 。此时，甲鱼绝对不会选择没有水覆盖的泥沙，因为这种环境下会随着温度降低而结冰，到时候甲鱼只能被冻死 。因此，它们必须要选择有一定水位（通常在1米以上）的泥沙中进行冬眠 。
有一定水位且在泥沙之中的甲鱼摆脱了严寒的困扰，找到了一个温度相对恒定的冬眠场所 。而场地选择好了之后，剩下的就是冬眠时的呼吸问题了 。由于甲鱼是口咽式呼吸的动物，说到底还是用肺呼吸的，但是在水下的泥沙中，它张嘴呼吸除了能吸到泥巴和水外，并不能获得氧气 。因此，甲鱼进化出了冬眠时的特殊呼吸方法 。
首先，加入冬眠状态后的甲鱼新陈代谢降到了最低，此时它身体的需氧量也大幅度的降低 。当然，降低了并不代表不用了 。这是龟鳖目下动物的一种特殊能力就要发挥作用了，龟鳖目下的所有具有两栖性的动物在泄殖腔的两侧都有一个器官-副膀胱 。这个副膀胱平时的作用不大，但是一旦到了水下，它就有了一个能力，那就是进行气体交换 。由于甲鱼的副膀胱上有大量的毛细血管，这些毛细血管能够吸收和排出水，同时将吸收的水中的氧气供给身体 。
因此，正是有了这对可以辅助呼吸的副膀胱，再加上冬眠时新陈代谢降低，这样就能满足甲鱼在水下的泥沙中待到来年的开春了（一般是在3-4月份结束冬眠） 。
总结
除了在热带生活的甲鱼不需要冬眠外，其他地区的甲鱼都需要进行冬眠，冬眠开始的时间根据环境温度的不同而不同，当甲鱼冬眠时，它们会潜入水下的泥沙中一动不动，靠自己的副膀胱吸收水中的氧气存活 。不过，如果是要养殖甲鱼，而且密度较大的话，在甲鱼冬眠之后，如果水面冰封，必须要在冰面上开多个孔，这让水中的氧气含量维持在一个相对高的标准下，这样有利于甲鱼的呼吸 。
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