6、太阳篇中的第一条是林亿辈新组合的条文
“太阳之为病，脉浮，头项强痛而恶寒”，后人都称之为太阳病的题纲 。但相关的条文，在高本《伤寒论》中是：“太阳为病，头痛项强而恶寒，其脉浮数，宜桂枝汤” 。在孙本《伤寒论》中则是两个独立的条文：“太阳之为病，头项强痛而恶寒”与“太阳病，其脉浮”；在《金匮玉函经》中与孙本相同 。这应该是林亿辈将“痓、湿、暍”三病从太阳病篇移出后，将两条合并为太阳病的题纲了；但条文只包涵了太阳伤寒与太阳中风的部分脉证，明显是有问题的！
7、太阳病中的第六条是林亿辈新校入的条文
太阳病中第六条，在高本与孙本《伤寒论》中都没有相关的内容；在《脉经·卷七》“病不可发汗病第一”中，虽有“风温”一词，但与这条的意义并非相同 。这条多数注家都是随文释义，虽然有个别注家也提到了阳明病，也并非理直气壮，而且对冒以太阳病的错误只字不提；更有一些注家，以此来炫耀《伤寒论》同样可以治温病，认为太阳病包括伤寒、中风、温病；还有一些注家，将这条作为《伤寒论》只能治伤寒，不能治温病的依据，又进一步将《伤寒论》狭义化了 。
8、二十九、三十条也是林亿辈新校入的条文
太阳病中的第三十条从文义上看，应该是对二十九条进行的阐释；但是，二十九条方证不对应，三十条象梦语一样颠三倒四 。林亿辈竟将这样的条文校入《伤寒论》中，说明了他们对《伤寒论》的认识也非常有限！
9、关于“重集诸可与不可方治”
在《伤寒论》与《金匮玉函经》的“辨不可发汗病脉证并治”中，开篇即言：“夫以为疾病至急，仓卒寻按，要者难得，故重集诸可与不可方治，比之三阴三阳篇中，此易见也 。又时有不止是三阴三阳，出在诸可与不可中也” 。这段在高本与孙本《伤寒论》上都没有相关的文字，应该是林亿辈以王叔和身份所作 。但王叔和重集诸可与不可方治，明显是因为不理解张仲景三阴三阳六病理论，对所搜采的其他经方家和医经家的个别条文，以及自己对治疗伤寒的某些认识，不知该置于何篇，于是就“又时有不止是三阴三阳，出在诸可与不可中也”，他认为“此易见也” 。
以上九条，也只是大致分析了林亿辈在校修《伤寒论》时所出现的明显错误，尤其是搞乱了张仲景的学术渊源！
四、《金匮要略》根本就不是张仲景的个人著作
北宋时，“翰林学士王洙在馆阁日，于蠹简中得《金匮玉函要略方》三卷：上则辨伤寒、中则论杂病、下则载其方并疗妇人” 。校正医书局林亿辈误认为是《伤寒杂病论》的节略本，并“以其伤寒文多节略，故断自杂病以下，终于饮食禁忌，凡二十五篇，除去重复，合二百六十二方，勒成上、中、下三卷，依旧名曰《金匮方论》” 。“然而或有证而无方，有方而无证，救急治病其有未备”；“又采散在诸家之方，附于逐篇之末，以广其方”；“使仓卒之际，便于检用”，即《金匮要略》，并署名汉·张机 。
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