1、内容上的的区别：
回函是发一封信函给别人，随后别人给的回复的信函；只有这一种情况 。
复函不仅同时有回函的含义，还包括某人发出一封信后，随后又补发了一封信给对方 。
2、运用场合的区别：
复函，适用于答复不相隶属机关的业务问题或上级机关的办公部门、业务职能部门答复下级机关的请示事项时使用 。这种函的针对性强，对方请求解决什么问题就回答什么问题，同时要求有一定的时效性 。
【函复和复函的区别 函复和复函的区别是什么】3、而回函的运用场合相比较之下就显得宽松多了，用在不严肃的场合 。可以用在亲友等关系亲密的情况下 。
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