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此实验主要由以下几点产生误差：由于预热不足，使测量值产生误差；在实验时，由于电压的步差不可能连续，故测量的峰值会有一定的误差；由于仪器老化，数据不够精确；画出氩的IP-VG2曲线是一个比较粗糙的过程，容易产生误差；需要测量的数据较多，容易计算错误 。
【弗兰克赫兹实验的误差分析】弗兰克—赫兹实验证明原子内部结构存在分立的定态能级 。这个事实直接证明了汞原子具有玻尔所设想的那种“完全确定的、互相分立的能量状态”，是对玻尔的原子量子化模型的第一个决定性的证据 。使用弹性碰撞和非弹性碰撞的理论，法兰克和赫兹给予了这实验合理的解释 。当电压很低时，被加速的电子只能获得一点点能量 。他们只能与水银原子进行纯弹性碰撞 。这是因为量子力学不允许一个原子吸收任何能量，除非碰撞能量大于将电子跃迁至较高的能量量子态所需的能量 。
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