狗近亲繁殖会有害于狗狗种族的进化， 近亲繁殖会导致狗狗体质不好、身体畸形、无繁殖能力等 。
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近亲繁殖是以血缘关系接近的雄狗和母狗交配， 例如父女、兄弟、姐妹、母子， 它们拥有共同的遗传因子， 生下的小狗会把其他优点特征加强和固定， 但缺点也会同时遗传 。 资深繁殖者会很小心慎重地观察其遗传性缺陷， 检查其是否有隐症、表毛、底毛、眼、腿关节、膝盖骨是否不正常等 。 但缺乏长期繁殖经验和遗传学基础的人， 千万不要尝试此法!因为失败几率相当高!
同血系间隔3-4代以上， 即共同祖先演变出来的公狗和母狗交配 。 因遗传因子固定平均化， 所以可繁殖出有安全性遗传因子同系统小狗 。 这种方法的优点时可以固定优点， 避免缺点而容易繁殖出优良幼犬 。
近亲繁殖配法”中的“反配法”是一种成熟的方法 。 举例来说， 主人饲养的母犬(命名为A)， 它产下了许多品相等方面都比较不错的后代， 其中有一只非常完美的公犬(命名为B) 。 当公犬B发育成熟之后， 就可以让它与A交配， 在生产出的小狗之中挑出比较完美的母犬C， 让C与B再交配 。 如此反复， 最后得到一批拥有完美性状(基因)的后代犬了 。 以上的这些理论都要基于一个条件：最初的公犬或是母犬， 必须是带有优良的基因， 无论是显性的(表现出来的)还是隐性的(没有表现出来的) 。 有缺陷的犬， 如体型， 毛色不符合标准， 甚至有耳聋、肢跛等患有生理机能障碍的犬是不能作为种犬来进行繁殖的 。
近亲繁殖“反配法”有什么好处
1、遗传性状非常稳定 。 当用“反配法”配种进行两至三次之后(上文中的C与B交配并产下幼仔) 。 幼犬的各种遗传性状应该是相当稳定的了， 即看到一只犬， 就基本上等于看到了他的后代， 这种稳定的特性是每一位繁殖者都希望得到的， 有些饲养者为了得到完美的幼犬到处寻找合适的公犬和母犬， 到最后配种结果也不一定令人满意， 而有些人则反复利用“反配法”轻轻松松的培育出许多完美的后代 。
2、很少会出现品种的退化现象或是产出有缺陷甚至畸形的胎儿 。 有些人认为这种繁殖配种方法有悖“伦理”， 并且拥有很高的胎儿畸形率 。 其实不尽然， 近亲繁殖产生畸形或是缺陷后代的原因并不是近亲繁殖本身， 而是它们身体中带有相同的致病基因或者说是缺陷基因 。 如果家族中没有致病基因或是缺陷基因的话， “反配法”是值得提倡的方法 。 因为这种方法可以使良好的基因得以保存， 保证子代对父代优良基因的完美传承， 并保证血统的纯正 。
近亲繁殖的时候可以加强父母双方的优点， 所以当想保留某只种公的优点时， 最好的方式就是与它的直女再进行交配 。 相对的， 若不成功时， 双方缺点的强化也是双倍， 所以在实施近亲繁殖时， 公犬与母犬一定要慎选 。 如果近亲繁殖成功是一只母犬是， 则可以再进行一次近亲繁殖， 假设其成果依然不错的话， 再下一次发情期则应该选择系统繁殖， 来定型已经强化之优点 。 因为连续数代的近亲繁殖(这机会很大， 但也不是绝对)可能会导致缺点重现及其他弊端， 例如生殖障碍、生命力与生活力等等， 此外， 也会有四肢方面的问题， 所以最好避免 。
但有些饲养者有这样的误区 。 举例来说， 它们会用一只比标准毛色偏深的犬， 与一只比标准毛色偏浅的犬交配， 以求它们的后代在毛色上符合标准， 这是基本不可能的事情 。 毛色的正常与否是由控制毛色的基因决定的， 遗传的规律是保持基因的正常延续， 即好的会一直好下去， 坏的也会一直坏下去 。 而不会产生中和的现象， 基因产生变异是极少的情况 。
